凝膠成像系統：如何為您選擇一個

快速：您實驗室中**常用的設備是什么？移液器可能占據shou位，但凝膠文件系統可能位居前三位。

凝膠文件系統實際上只不過是一個微型暗室和相關的相機。在80年代后期和90年代早期，這些系統實際上是便攜式暗室，包括安裝在金字塔底座上的基本寶麗來打印相機。將組件放在燈箱上的凝膠上，然后拍攝照片。一旦開發打印所需的幾秒鐘過去，生成的灰度照片就會粘貼到實驗室筆記本中。

但DNA和蛋白質凝膠不僅僅是令人欽佩的圖像，就像家庭相冊中的照片一樣; 他們是數據。必須對它們進行研究，分析，注釋和（希望）發表。它們還必須存儲并可供以后檢索。不幸的是，這些任務對于打印圖像來說都不是很簡單，打印圖像可能會損壞或丟失，并且必須掃描到計算機中以進行后續圖像分析。

幸運的是，今天的實驗室工作人員有更復雜的選擇?，F代凝膠文件系統的范圍從半自動到全自動，具有多功能外殼，計算機控制的激發和檢測系統以及分析軟件。這些裝置不僅可以處理DNA和蛋白質凝膠，還可以處理化學發光蛋白質印跡，熒光，甚**放射自顯影。出于本文的目的，我們將討論限制在**基本的系統 - 那些可以處理DNA和蛋白質凝膠的系統。

應用

購買凝膠文件系統時，shou先詢問，我的需求是什么？您是否將該系統專門用于DNA和蛋白質凝膠，或者您是否還需要記錄熒光實驗，化學發光蛋白質印跡和放射自顯影？在前一種情況下，幾乎所有系統都會這樣做，您的選擇將取決于您想要花多少錢以及您決定需要哪些功能; 在后一種情況下，您需要考慮更**的選擇。

“通常，切斷點是，他們是在做化學發光西部片嗎？” Cell Biosciences的產品經理Peter Chiang說?；瘜W發光需要冷卻的CCD相機，這比通常與凝膠文件系統捆綁的相機貴得多。

價錢

蔣說，一旦潛在客戶確定了他們的應用程序，他們shou先要知道的是，系統將花費我多少錢？“這通常是討論開始的地方，價格范圍是多少，”蔣說。

當然，這是俄亥俄州立大學獸醫學院研究科學家Kate Hayes-Ozello的“**大因素”，他參與購買學院的兩個AlphaImager系統（**初由AlphaInnotech出售，現在由細胞生物科學）。“價格是我看到的**件事，”她說。

一般來說，基本的凝膠文件系統的價格可能低于10,000美元，可能低于5,000美元，具體取決于相機質量，自動化水平和系統捆綁軟件質量等特性。例如，Cell Biosciences的凝膠文件系統從基本的AlphaImager Mini的3,800美元到**的AlphaImager HP的12,000美元。

燈光

DNA和蛋白質凝膠具有相對簡單的照明要求。對于用溴化乙錠或SYBR綠染色的DNA凝膠，您需要一個紫外透射儀。對于考馬斯染色的蛋白質凝膠，你需要白光透照。您可能還希望進行白光落射照明（即，從上方照射）用于成像，例如細菌板，和/或藍光“轉換器屏幕”，其可以將UV光轉換為藍光以切除SYBR綠 - 染色DNA條帶而不損壞它們。（如果您確實需要從凝膠中切除條帶，請尋找可以將透照儀從系統機柜中取出以便于接觸凝膠的系統。）

攝像機/光學

當然，凝膠文件系統操作的關鍵是用于捕獲圖像的相機和鏡頭。

“你可能shou先要看的是相機，”蔣說，“這通常是**昂貴，**具差異化的部分。”

shou先，蔣說，解決; 大多數gel-doc系統都有“科學級”相機，分辨率在0.3到2百萬像素（MP）之間，他說 - 低于1 MP的任何東西都被認為是“低端的”。

接下來，考慮一下鏡頭。它們是固定的，還是可以放大？什么是**大放大倍率，是變焦光學（即鏡頭實際移動）還是電子（如手機相機）？鏡頭是電腦控制的還是手動的？**后，根據您的需要，您可能還需要考慮可以在相機前放置多少個不同的濾鏡。

例如，AlphaImager Mini包括一個1.3-MP，12位攝像頭（一個12位攝像頭可以捕獲2 12或4,096個灰色陰影），一個位置的濾光輪（標準配置包括一個橙色濾鏡）對于溴化乙錠，雖然有其他可用）和手動變焦鏡頭（8-48毫米，f / 1.2）。所述Syngene公司 GENI包括2-MP，12位的攝像頭，馬達驅動，六位置濾光輪，和一個電動變焦。

使用方便

鑒于您可以期待凝膠文件系統的使用量，易用性是一個關鍵考慮因素。

“實驗室應該考慮我（例如，實驗室經理）使用的容易程度，以及我將需要培訓多少人，” Bio-Rad實驗室成像營銷經理Ryan Short說。“或者，系統是否如此直觀，您可以立即行走并立即使用它？”

Hayes-Ozello的購買決定考慮了簡單性，因為她購買的系統是部門資源。“只需極少的培訓，用戶就可以拍照并快樂地走，”她說。“它不需要核心經理的大量培訓......這才是我們真正想要的。”

易用性難以量化，Short承認，但有一些因素需要考慮。例如，拍攝照片需要多少操作相機設置，以及這些任務的自動化程度如何？“你可以走到系統，按幾個按鈕，拍出好照片，還是你需要調整焦距，變焦和光圈？” 他問。

軟件

當然，易用性計算的一部分是用于捕獲和分析圖像的軟件。即使是**基本的凝膠文檔系統也包括采集軟件，它應該允許用戶控制亮度，變焦和聚焦。但并非所有系統都能讓您分析圖像（例如，識別泳道，量化特定條帶中的DNA量，并測量其分子量）。

例如，AlphaImager Mini包括采集軟件，但分析軟件是可選的。但是，AlphaImager HP包括兩種標準。另一方面，Syngene的GeneTools分析軟件包及其所有凝膠文件系統，產品和銷售支持**Maggie Pochyla說。“我們的核心競爭力之一就是軟件，”她說。

在考慮系統附帶的軟件時，還要考慮如何使用該系統的后勤。采集軟件只需要安裝在與設備相關的計算機上，但分析軟件呢？大多數研究人員可能更愿意在他們自己的計算機上處??理這些數字，特別是如果凝膠文檔系統在核心設施中或有一個隊列使用它。“你不想站在機器旁邊進行分析，”肖特說。

因此，請詢問系統捆綁了多少軟件許可證，以及您收到多少次升級（或者您有多長時間獲得這些許可證）。如果分析軟件已聯網，請務必與您的IT部門核實，以避免任何安裝問題。

什物

基本的凝膠文件系統并不多，但正如他們所說，魔鬼在細節中?？紤]到這一點，這里還有一些其他選擇：

系統是否可升級？
例如，如果您現在不需要化學發光或熒光，但預計在未來幾年內需要這些功能，您可以升級現有系統，還是必須購買一個全新的系統？“每個人都會選擇這種模塊化的軟件和硬件，”Pochyla說，“所以你不必購買勞斯萊斯，你可以買到你需要的東西。”

什么是系統足跡？
在大多數實驗室中，空間非常寶貴，因此系統越小越好。一些凝膠doc系統由相關的PC控制; 其他（例如Syngene GENi和Cell Biosciences Red）具有帶觸摸屏界面的內置計算機。

你將如何檢索你的數據？（通過網絡？使用USB密鑰？）
將圖像轉換為出版品質的數字有多容易？軟件可以自動導出到高分辨率圖像（通常為300 dpi或更高），還是必須使用其他軟件（如Adobe Photoshop）來執行此操作？

供應商多久更新一次軟件？
凝膠文件系統的使用壽命大約為七到八年，估計很短，因此提前考慮很重要。“你想確保系統提供對當前操作系統的訪問，”他說。